数多の武芸者が”最強”を求め命を懸けた伝説の武芸仕合『海原大仕合』から２年。『海原大仕合』で天下無双と謳われた千石伊織の元に徳川幕府より、戦いへの誘いが届く。敵は幕府が”最強”を決めるため選んだ武芸者たち、その名は”幕下百剣”。伊織に付き従うのは、剣に魅せられた一ノ瀬家の娘・蘭。いずれも一騎当千の強者たちを相手に、千石伊織の新たな戦いが幕を開ける！！
ついに幕下大仕合本戦が始まる！！ 本戦を前に伊織を訪ねてきたのは将軍兵法指南役・柳楽！ その口から語られたのは幕下大仕合の裏に隠された将軍家の秘事、そして恐るべき強者の存在だった！ いっぽう我間の元を訪れたのは無宝流・宮藤四門。無宝流の強者三人に囲まれ、我間は大きな選択を迫られる！！
