西暦2062年、銀河の各地で種を問わず発生した原因不明の現象「ヴァール症候群」──人類が移住した惑星ピプレでも、寒冷地に棲む大型生物が発症によって凶暴化し、人々の生活を脅かしていた。この事態に対し、この惑星の警備を担当する星間複合企業体ケイオスは、歌による鎮静化実験を立案。人類の存亡を懸けたミュージカルが幕を開ける……!! 大人気TVアニメシリーズ最新作『マクロスΔ』の幕開けへと繋がる時代を描く、公式外伝作品!
原生巨大生物“鰻蟲(ウナムシ)”が凶暴化する「ヴァール症候群」は、ピリカの失踪した父であり、カイトのヲタ友でもある、イワン・ツァーリが計画的に誘発したものだった!! さらなる大規模な“ヴァール”を起こすため、イワンはとんでもない謀略を実行に移す…!! 最後の敵は“超時空要塞マクロス”!? 人類の生き残りを賭け、カイトとピリカが空前絶後のラストステージに挑む……!!